Debutó en 1.ª ronda batiendo al belga Christophe Rochus por un claro 6-0, 6-2 y 6-2. En 2.ª ronda venció al croata Roko Karanušić por 6-2, 6-3, 6-2. En 3.ª ronda venció al alemán excampeón de Grand Slam, Tommy Haas por un claro 6-4, 6-2 y 6-2, en 4.ª ronda venció al chileno y n.º 13 del mundo Fernando González por un fácil 6-3, nueva camiseta del valencia 6-2 y 6-4 cobrándose revancha de lo ocurrido en los cuartos de final del Abierto de Australia 2007 y de esta forma accediendo a la segunda semana del torneo australiano mostrando un gran tenis. En tercera ronda aplastó al alemán Michael Berrer por 6-0, 6-1 en solo 54 minutos, de esta forma Nadal solo cedió 2 juegos en sus 2 primeros partidos en el Principado ofreciendo un recital de tenis, como dato, en 2 días, Rafa apenas estuvo 1 hora y 54 minutos en cancha. En semifinales vence al serbio Viktor Troicki por 6-1 y 6-3 para llegar a su primera final oficial del año, confirmando estar en gran forma, sin embargo, en la final Nikolái Davydenko lo derrotó por 6-0, 6-7(8) y 4-6 con Nadal teniendo 2 puntos de campeonato en el tiebreak del segundo set, quedando con un cara a cara negativo de 4-5 en 9 enfrentamientos frente al ruso y 0-3 en finales (rival a quien nunca pudo vencer en finales).
Debutó en la jornada diurna contra Robin Söderling (su último duelo fue la histórica derrota de Nadal en Roland Garros), contra quien cayó por 4-6 y 4-6. En su segundo partido se midió al ruso Nikolái Davydenko, en un duelo en el que perdía quedaba eliminado del torneo, finalmente Nadal cayó por 1-6 y 6-7(4) quedando ya sin opciones de avanzar a semifinales y acabar el año como 1. En su tercer partido se midió contra Novak Djokovic, el cual era para cerrar su participación ya que pase lo que pase ya estaba eliminado, perdió por 6-7(5), 3-6 en 1 hora y 58 minutos cerrando su participación con 0 victorias y 3 derrotas, sin siquiera poder ganar un set en su peor participación en un Torneo de Maestros. Debutó en 1.ª ronda venciendo al WC chipriota Marcos Baghdatis por un luchado 6-4, 3-6 y 6-4. En 2.ª ronda tuvo otro difícil partido contra el James Blake ganando por 7-5, 6-7(4), 6-3. En cuartos de final derrotó al WC ruso y ex número uno del mundo, Marat Safin por un claro 6-3 y 6-1, en semifinales cayó ante el croata y núm. 15 del mundo Marin Čilić por un claro 1-6 y 3-6 en 1 hora y 22 minutos.
Debutó en 2.ª ronda enfrentando al argentino de Ranking Protegido, Juan Ignacio Chela, ganándole por un claro 6-2 y 6-3. En 3.ª ronda venció al ecuatoriano Nicolás Lapentti, proveniente de la clasificación, por un fácil 6-3 y 6-0. En cuartos de final venció al WC croata Ivan Ljubičić por doble 6-3. En semifinales venció al n.º 4 del mundo Andy Murray por 6-2, 7-6(4) para acceder a su quinta final consecutiva en el Principado. Debutó el miércoles 14 de abril en segunda ronda contra el neerlandés Thiemo de Bakker, el cual fue un mero trámite para el español ganando por un claro 6-0 y 6-1 en solo 60 minutos. La final se jugó el 19 de abril, allí venció al serbio y n.º 3 del mundo Novak Djokovic por 6-3, 2-6 y 6-1 en 2 horas y 43 minutos para ganar por quinta vez consecutiva el Masters de Montecarlo (un récord en la Era Abierta).
En semifinales del torneo parisino cayó ante el eventual campeón el serbio Novak Djokovic por un claro 2-6 y 3-6. Nadal gracias a que Federer cayese en segunda ronda logró situarse a 945 puntos del número uno actual, Roger Federer, sabiendo que en las ATP Finals podría ser otra vez número uno del mundo, ya que empezando el torneo Federer perdería 200 puntos (quedando a 745) y Nadal nada ya que el año pasado no lo jugó por una lesión en la rodilla. Sufrió una rotura abdominal durante el Masters de Cincinnati, pero aun así decidió jugar el US Open de todos modos, pero una vez acabado el torneo, los médicos le recomendaron parar para no agravar la lesión, por lo que se vio obligado a bajarse de la llave de semifinales de Copa Davis entre España e Israel a disputarse en Murcia (acabó en triunfo español por 4-1) y también del Torneo de Bangkok. Abrió la serie enfrentando al checo N.º 1 Tomáš Berdych ganando por un claro 7-5, 6-0 y 6-2 para aventajar a España, el sábado Fernando Verdasco y Feliciano López vencieron en el dobles y los españoles se quedaron con la Copa Davis por cuarta vez en su historia, segunda consecutiva.